こんにちは。この現象は、Windows 11の新しいメモ帳アプリで導入された仕様変更が原因です。デフォルトで以前のセッションを復元する設定になっています。
この設定を無効にするには、以下の手順に従ってください。
メモ帳を起動します。アプリの右上隅にある歯車（⚙️）の形をした「設定」アイコンをクリックします。設定画面が開いたら、「メモ帳の起動時」というセクションを探します。ここで、現在の設定が「以前のセッションからコンテンツを開く」になっているはずです。これを「新しいウィンドウで開く」に変更します。これで、次回以降メモ帳を起動した際には、新しい空のウィンドウで開くようになります。
補足情報：キーボード操作で設定画面を開きたい場合は、Alt + Sキーを押すことで直接アクセスできます。