昨日、私も全く同じ問題に遭遇しましたが、試行錯誤の末、非常に簡単な解決策を見つけました！
どのマルウェア対策ソフトも効果がありませんでしたが、以下の手順で直ちにポップアップが停止しました。
お使いのブラウザ（EDGEの場合）の設定を開き、以下の手順をお試しください。
設定メニューから「Cookieとサイトのアクセス許可」に進みます。「サイトのアクセス許可」セクションの「すべてのサイト」を選択します。「最近のアクティビティ」に注目してください。ここに最近許可を与えたサイトのリストが表示されます。問題のポップアップが表示されるようになった日以降のサイトを一つずつ開き、ページ上部にある「アクセス許可をリセット」を実行してください。私はリストのサイトをすべてリセットしました。この方法が、同じ問題で困っている方々の助けになることを願っています。