WinSxS\Temp\InFlightフォルダについて補足します。
このフォルダは、Windows Updateや機能の追加・削除といった「サービス操作」中に使用される一時的な作業領域（ステージング領域）です。
具体的には、以下のような役割があります。
- 更新プログラムの新しいファイルを一時的に保持する。
- 操作が完了するまで、システムファイルを安全な場所に退避させる。
サービス操作が正常に完了すると、このフォルダ内のファイルは自動的にクリーンアップされます。 そのため、手動で削除しようとするとアクセスが拒否されたり、最悪の場合、更新プロセスが破損したりする可能性があるため、触らないのが安全です。
質問者様の場合、インプレースアップグレードのプロセス中、またはその後のシステムメンテナンスで自動的にクリーンアップされたものと考えられます。