無償アップグレードは、現在のWindows 10環境（ファイルやアプリを保持した状態）をWindows 11にアップグレードすることを指します。その過程で、Windows 10のライセンスがWindows 11のライセンスに変換・認証されます。
ただし、この無償アップグレードの対象となるのは、元々Windows 10として購入されたライセンスです。Windows 7や8から無償アップグレードされたWindows 10のライセンスは、Windows 11への無償アップグレードの対象外となるため注意が必要です。
お使いのドライブがUEFIで認識されない問題は、ディスクがMBR形式であることが原因だと思われます。Windows 10に標準搭載されているmbr2gpt.exeツールを使用すれば、データを保持したままGPT形式に変換できます。
MBR2GPT.EXE - Windows Deployment | Microsoft Learn
上記ドキュメントをよく読み、手順を理解した上で実行してください。一度変換すると元に戻すことはできません。正常にGPTへ変換し、Windows 11へアップグレードした後であれば、いつでもクリーンインストールを行うことが可能です。