はい、結論から言うとNordVPNの脅威対策とWindows Defenderは問題なく併用できます。
NordVPNの脅威対策に含まれる「ファイル保護」機能は、デバイス上のファイルをスキャンするのではなく、あくまで「ダウンロードするファイル」をスキャンするものです。
このため、Windows DefenderはNordVPNを本格的なウイルス対策ソフトとは見なさず、自動的に無効になることはありません。結果として、両方の機能を同時に有効にしておくことが可能です。
詳細は下記の公式サイトにも記載があります。
脅威対策は、ウイルス対策ソフトが通常行うような、お使いのデバイスのローカルスキャンを実行しません。そのため、本格的なウイルス対策ソフトというわけではありません。
https://nordvpn.com/ja/features/threat-protection/
※上記はMicrosoft以外のサイトへのリンクです。サイトに掲載されている広告には、PUP(潜在的に不要な製品)として分類される可能性のある製品が含まれている場合がありますので、ダウンロードやインストールを行う前に十分にご確認ください。